超声波扫描显微镜的两个偏振滤光片互为90°，以获得所谓的“暗位”，此时视野是全黑的，如果样品在光学上表现为各向同性(单折射体)，则无论怎样旋转载物台，视场仍是黑暗，这是因为起偏镜所形成的线偏振光的振动方向不发生变化，根据马吕斯定律，透射光的强度为0。如果样品具有双折射特性，则视野会变亮，这是由于从起偏镜射出的线偏振光进入双折射体后，产生振动方向不同的两种直线偏振光(o光和e光)，当这两种光通过检偏镜时，由于e光并不服从折射定律，其与检偏镜偏振方向不是90°，所以可透过检偏镜，视野上就可以看到明亮的象。
超声波扫描显微镜的应用：
生物领域：在生物体中，不同的纤维蛋白结构显示出明显的各向异性，使用超声波扫描显微镜可得到这些纤维中分子排列的详细情况。如胶原蛋白、细胞分裂时的纺缍丝等。
各种生物和非生物材料鉴定：如淀粉性质鉴定、药品成分鉴定、液晶、DNA晶体等。
地矿分析：如种矿物及结晶体的分析。
医学分析：如结石、尿酸晶体检测、关节炎等。
材料显微组织的各项同性和异性等。
超声波扫描显微镜使用的注意事项：
1、调焦时注意不要使物镜碰到试样，以免划伤物镜。
2、当载物台垫片圆孔中心的位置靠近物镜中心位置时不要切换物镜，以免划伤物镜。
3、亮度调整切忌忽大忽小，也不要过亮，影响灯泡的使用寿命，同时也有损视力。
4、所有(功能)切换，动作要轻，要到位。
5、关机时要将亮度调到小。
6、关机不使用时，将物镜通过调焦机构调整到低状态。
7、关机不使用时，不要立即该盖防尘罩，待冷却后再盖，注意防火。
